La historia de la química de los alimentos y su origen son inexactos ya que la química de alimentos no obtuvo una identidad propia hasta el siglo 20.
A comienzos de el siglo 18 pocos investigadores comenzaron a estudiar sobre algunos alimentos, como el ácido málico en las manzanas en 1785 por Carl Mondana y se publicó el primer libro sobre la agricultura relacionado con la química en 1813 llamado "Elements of Agricultural Chemistry" por Sir Humphry.

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